Il Kampioenschap van Vlaanderen 2000, ottantacinquesima edizione della corsa, si svolse il 15 settembre 2000 su un percorso di 182 km, con partenza e arrivo a Koolskamp. Fu vinto dal belga Niko Eeckhout della Palmans-Ideal davanti all'olandese John Talen e al belga Chris Peers.