La stagione 2004 della Formula Nippon fu corsa su 9 gare. 8 differenti team e 17 differenti piloti vi presero parte. Tutti utilizzano vetture LolatelaioLola B3/51 e motori Mugen HondaMF308.
Al termine delle competizioni il titolo venne aggiudicato al pilota britannicoRichard Lyons. Da registrare la prima gara svoltasi al di fuori del territorio giapponese, sul Circuito di Sepang in Malaysia.
^In gara 4 una gara sprint determinò la griglia nella gara effettiva. Venne corsa su 18 giri, pari a 104,526 km col tempo di 33:00.186, alla media di 190,029 km/h, il vincitore Richard Lyons partì così dalla pole.
^In gara 7 una gara sprint determinò la griglia nella gara effettiva. Disputata Su 20 giri, pari a 110,72 km, col tempo di 38:01.564, alla media di 174,701 km/h, il vincitore André Lotterer partì dalla pole. Il più rapido dei qualificati alla gara sprint fu Naoki Hattori.